W Areszcie Śledczym w Elblągu przebywają tymczasowo aresztowani, pozostający do dyspozycji Prokuratury i Sądu Rejonowego w Braniewie i Elblągu oraz Prokuratury i Sądu Okręgowego w Elblągu, a także skazani i ukarani. Całkowita pojemność aresztu, włącznie z oddziałem zewnętrznym w Braniewie utworzonym w kwietniu 2018 roku, wynosi 491 miejsc. Jest to jednostka typu zamkniętego, przeznaczona dla dorosłych i młodocianych skazanych odbywających karę po raz pierwszy. W areszcie znajduje się także oddział terapeutyczny dla osób uzależnionych od substancji psychoaktywnych innych niż alkohol.
W Oddziale Zewnętrznym w Braniewie przebywają skazani zakwalifikowani do odbywania kary w zakładzie karnym typu półotwartego oraz skierowani do oddziału terapeutycznego dla osób z niepsychotycznymi zaburzeniami psychicznymi lub upośledzeniem umysłowym (P-1/t, M-1/t).