Areszt Śledczy w Bydgoszczy przeznaczony jest dla tymczasowo aresztowanych mężczyzn i kobiet, a także skazanych mężczyzn zakwalifikowanych do grupy i podgrupy R-1. Jednostka ma pojemność 643 miejsc. W ramach Aresztu Śledczego w Bydgoszczy funkcjonuje również Oddział półotwarty dla młodocianych kobiet oraz kobiet odbywających karę po raz pierwszy. Jednostka zgodnie ze swoim przeznaczeniem przyjmuje także:
Kobiety i mężczyzn wymagających leczenia szpitalnego w oddziałach wieloprofilowym zachowawczym oraz chirurgii ogólnej,
Tymczasowo aresztowanych i skazanych (kobiety i mężczyzn) wymagających całodobowej opieki lekarskiej,
Kobiety i mężczyzn skierowanych do ośrodka diagnostycznego,
Tymczasowo aresztowanych i skazanych (kobiety i mężczyzn) objętych programem substytucji metadonowej.
Oddziały zewnętrzne
Od 1 grudnia 2021 roku w strukturze jednostki znajdują się również:
Oddział Zewnętrzny w Bydgoszczy-Fordonie z pojemnością 608 miejsc,
Oddział Zewnętrzny w Strzelewie z pojemnością 238 miejsc.
